במהלך ימי הלחימה האחרונים, עם החרפת האיומים הביטחוניים וירי הרקטות לעבר המרכז וצפון הארץ, עבר המרכז הרפואי שמיר (אסף הרופא) לפעול בהתאם לפרוטוקול חירום - וכיוצא מכך, העביר את כלל הפעילות הכירורגית לחדרי ניתוח ממוגנים. בין היתר, נפתחו לראשנו חדרי ניתוח במתחם תת-קרקעי, שהותאם לפעילות רפואית מלאה.
בתוך המתחם, המשמש בימי שגרה כחניון תת-קרקעי, בוצעו שבוע עבר ניתוחים מורכבים להסרת גידול ממאיר במעי הגס. לדברי מנהל המחלקה הכירורגית בבית החולים, פרופ' זמורה, הגידול איים לחסום את המעי, ולכן היתה אינדיקציה להסירו גם בעת מלחמה.
בשל הסיבה שמדובר במתקן לא שגרתי, הכנתו לניתוחים הייתה אתגר לוגיסטי ורפואי מורכב. "הניתוחים בוצעו תוך שיתוף פעולה בין הצוותים הלוגיסטיים, צוותי חדר ניתוח, צוותי ההרדמה והצוותים הכירורגיים",
בסיום הניתוחים, הועברו המטופלים להתאוששות במתחם תת-קרקעי ייעודי, המצויד במלוא הציוד הרפואי הנדרש, ובהמשך אושפזו במחלקת האשפוז במתחם החירום המדובר.