ראש המל"ל צחי הנגבי התנגד לאחרונה לשתי החלטות דרמטיות שאותן לקח ראש הממשלה בנימין נתניהו. ההחלטה הראשונה הייתה תעדוף כיבוש עזה על פני עסקה מדורגת, וההחלטה השנייה היא ביצוע התקיפה בקטאר בתחילת חודש ספטמבר. על רקע הדברים, מקורות פוליטיים טוענים למתיחות בין רה"מ לראש המל"ל, שלא הצטרף לטיסת ראש הממשלה לארצות הברית באופן חריג.
הנגבי מייצג את אחד מגורמי המקצוע המשמעותיים ביותר בנושאים הביטחוניים, ומתוקף תפקידו מעורב פעמים רבות בנושאי קבלת ההחלטות בנוגע למו"מ לעסקת שחרור חטופים וסיום המלחמה.
על ההתנגדות למבצע "מרכבות גדעון ב'" פרסמנו לראשונה ב"מהדורה המרכזית" שם חשפנו כי לא רק הרמטכ"ל אייל זמיר הציג עמדה והמלצה ביטחונית נגד היציאה למבצע, אלא גם ראש המל"ל הנגבי, שדיבר באופן חריג נגד החלטת ראש הממשלה בקבינט הביטחוני-מדיני.

"אני לא מוכן לוותר על הצלת החטופים", אמר ראש המל"ל בקבינט. "אני לא מבין כיצד מישהו שצפה בסרטונים של אביתר ורום, וגם בכל אלה שפורסמו לפניהם, יכול לתמוך באמירה 'הכול או כלום'. המשמעות היא ויתור על הסיכוי לחלץ מיד לפחות 10 חטופים, כי חמאס לא יענה לתכתיב הזה".
הנגבי הוסיף כי "הפסקת אש תאפשר לנסות להגיע להסכם על ה-10 הנותרים. אני מסכים לחלוטין עם הרמטכ"ל שהשתלטות על העיר עזה מסכנת את חיי החטופים, ולכן אני מתנגד להצעת ראש הממשלה". נציין כי המקרה שהנגבי מתנגד לעמדת ראש הממשלה הוא אירוע נדיר למדי.
הנגבי הסביר בפני חדשות 12 שאין שום מתיחות בין השניים, והנסיבות לאי-הגעתו לוושינגטון היא מסיבות אישיות. הוא הוסיף ש"ימשיך בתפקידו כרגיל, עד לסוף הקדנציה". מלשכת ראש הממשלה נמסר: "בניגוד לדיווחים השונים, ראש המל"ל צחי הנגבי לא הצטרף לנסיעתו של ראש הממשלה לארה״ב עקב סיבות אישיות ולא מעבר לכך, ואנו מכבדים את פרטיותו".