כפי שנחשף הערב (חמישי) ב"מהדורה המרכזית", ממצאי התחקיר שערכה המשטרה בעקבות התנהלות השוטרים בהלוויתה של העיתונאית שירין אבו עאקלה חושפים כי בן משפחתה של כתבת אל-ג'זירה התריע בפני המשטרה בשיחת טלפון כי ארונה נחטף בבית החולים על ידי קיצוניים - מה שגרם לכוחות לפרוץ למתחם. בינתיים, ברשת אל-ג'זירה פרסמו תמונה של קליע שלטענתם - הרג את העיתונאית.
התחקיר, שנערך על ידי המשטרה, נועד לצרכי לימוד והסקת מסקנות - ולא למטרות ענישה, כך קבע המפכ"ל רב-ניצב קובי שבתאי. האירוע המרכזי שבו התמקד התחקיר, וגם גרר תגובות רבות ברחבי העולם, היה הובלת ארונה של העיתונאית שכזכור, כמעט ונפל לאחר שהשוטרים התעמתו עם נושאי הארון. על כך, ממצאי התחקיר העלו כי השוטרים שגו שבחרו לעשות שימוש באלות כנגד נושאי הארון שהיו קרובים להפלתו בעקבות כך.
עם זאת ולפי התחקיר, כניסת הכוחות לשטח בית החולים הייתה מוצדקת. קרוב משפחה מדרגה ראשונה של העיתונאית מיהר להודיע לקצין המשטרה על מסע לוויה רגלי לעיר העתיקה שמתוכנן על ידי גורמים קיצוניים שהשתלטו על הארון - בניגוד להסכמת המשפחה שמצידה, ביקשה סיוע מיידי מהמשטרה.
למרות זאת, דוח התחקיר כן מותח ביקורת על כך שאת ההחלטה לפרוץ לבית החולים קיבל קצין משטרה זוטר, ולא הקצין הבכיר ביותר בשטח - כמתחייב מרגישות האירוע. אחת מהמסקנות המרכזיות בתחקיר היא שהצבת הכוחות סביב בית החולים הייתה חייבת להיעשות מוקדם יותר, כך ניתן היה למנוע את כניסתם של גורמים עוינים שכול מטרתם הייתה להתעמת עם השוטרים ולהפר את הסדר, כולל חטיפת הארון.
בתוך כך, רשת אל-ג'זירה מפרסמת תחקיר משלה על מותה של העיתונאית וטוענת שיש בידיה תיעוד של הקליע שהרג אותה. לפי הרשת, הקליע התעוות כתוצאה מהפגיעה בראשה והוא מהסוג שמסוגל לחדור דרך שריון. הם גם הציגו את סוג הנשק, הנמצא בשימוש צה"ל לטענתם, שממנו נורה הקליע שהרג אותה.