לאחר שמוקדם יותר נהרג נער מירי כוחות הביטחון לאחר שהחזיק בידו נשק דמה שאותו כיוון לעבר הלוחמים, במחנה הפליטים שועפאט ובשכונות נוספות במזרח ירושלים התפתחו אמש (רביעי) עימותים בין פלסטינים לשוטרים. שני תושבי סילוואן נפצעו בינוני מירי של קצין מג"ב לעבר מפרי סדר. כוחות משטרה נכנסו גם לשכונת עיסאוויה.
על פי החשד, השניים שנפצעו בסילוואן ניסו ליידות בקבוק תבערה ולשגר זיקוקים לעבר הלוחמים. לטענת הקצין, הוא חש בסכנת חיים ולכן נאלץ לירות לעברם מטווח קצר יחסית. הפצועים פונו להמשך טיפול בבית החולים. לפי המשטרה על הפצועים נמצאו סכין יפנית, דגל חמאס וכוורת זיקוקין.
מהמשטרה נמסר: "בשעה האחרונה פועלים כוחות המשטרה של מחוז ירושלים ולוחמי מג"ב בשכונת סילואן, בעקבות הפרות סדר אלימות והתפרעויות, הכוללות יידויי בקבוקי תבערה וירי זיקוקין לעבר הכוחות בניסיונות לפגוע בהם. בתוך כך כוח מג"ב חתר למגע במטרה לעצור את החשודים".
עוד הוסיפו במשטרה: "בשלב מסוים, קצין מג"ב שפעל במקום וחש בסכנה לחייו בעקבות ירי זיקוקין בכינון ישיר וידויי בקבוק תבערה לעברו מטווח של מטרים בודדים, ביצע ירי מדויק לעבר שני החשודים ונטרל אותם. שני המפגעים נפצעו באורח בינוני ופונו לקבלת טיפול רפואי. אין נפגעים לכוחותינו, ובשעה זו כוחות המשטרה ומג"ב ממשיכים לפעול באזור בכוחות מתוגברים להדיפה ופיזור המפגעים ומפרי סדר".
מוקדם יותר כוחות משטרה פעלו במחנה הפליטים שועפאט והרסו את ביתו של המחבל שרצח את סמלת נועה לזר ז"ל בפיגוע במחסום בכניסה למחנה בחודש אוקטובר. במהלך הריסת הבית החלו עימותים עם התושבים והמשטרה ירתה בנער שנחשד כמחבל. הפלסטינים הכריזו על קיום "צעדת זעם". חמאס טען כי הנער פעל במסגרת הארגון.
במשטרה הסבירו את שהתרחש: "לקראת סיום הפעילות, זיהו הכוחות אדם חמוש המכוון לעברם נשק. בעקבות הסכנה שנשקפה ממעשיו של החשוד, בוצע לעברו ירי מדויק, הוא נוטרל ולאחר שהכוחות העניקו לו טיפול רפואי ראשוני נקבע מותו. בהמשך, בבדיקת הנשק שהיה בידיו ע"י חבלנים, התברר כי מדובר בנשק דמה שדומה לנשק מסוג קרלו ובבדיקת זהותו של החשוד עולה כי מדובר בתושב מחנה הפליטים שועפאט, בן 18".