הספינה הבריטית מדלן, שעליה 12 פעילים פרו-פלסטינים ועשתה את דרכה לעזה - נבלמה על ידי כוחות שייטת 13 במהלך השעות המוקדמות של הבוקר (שני). במשרד החוץ פרסמו תיעוד מהסיפון, שבו חיילי צה"ל מחלקים לפעילי "משט החירות" מים וכריכים, והצהירו: "כל הנוסעים בטוחים - המופע נגמר". "משט החירות" למעשה סיים את דרכו, ובהמשך הפעילים יהיו כפופים להוראות כוחות הביטחון.
גורם ישראלי בכיר אמר לאחר ההשתלטות: "אנחנו עוטפים את עזה מכל כיוון במטרה לחנוק את חמאס, ולא לאפשר לו לקבל כל סיוע מגורם שלא בפיקוח ישראלי". אותו גורם הוסיף כי "אם נאפשר כניסה של משט אחד, יבואו בעקבותיו המונים והפרובוקציה הזאת תייצר גל של משטים שעוינים את ישראל. לא ניתן לזה יד".
לאחר ההשתלטות: המשך הדרך עבור הפעילים בישראל
- הגעה לנמל אשדוד בספינה מדלן, שם תיעצר לחלוטין
- צפייה ב"סרט הזוועות" שנוצר מחומרים מצולמים מאירועי 7 באוקטובר
- נסיעה מאובטחת לנתב"ג
- עלייה על טיסות כל אחד למולדתו וגירוש מישראל
בחיל הים ובשייטת 13 בפרט התכוננו להגעת המשט למים הטריטוריאליים של ישראל, אך הוחלט לנקוט משנה זהירות בעקבות מעורבותן של צרפת ובריטניה במשט. בחיל הים תרגלו בימים האחרונים מספר תרחישים - וזה מה שהוחלט לעשות, כך שהתוכנית פעלה חלק בדיוק לפני התרחישים שעליהם התאמנו בחיל הים.
שר הביטחון ישראל כ"ץ בירך על ההשתלטות "המהירה והבטוחה" על המשט, והסביר מדוע הנחה את צה"ל להקרין בפני המשתתפים את סרט הזוועות מ-7 באוקטובר. "ראוי שגרטה האנטישמית וחבריה תומכי החמאס יראו בדיוק מיהו ארגון הטרור חמאס שבו באו לתמוך ולמענו הם פועלים, מה מעשי הזוועה שביצעו בנשים, זקנים וילדים ומול מי ישראל נלחמת להגנתה", אמר.
שר הביטחון הבהיר כי "צה"ל ימשיך במלחמתו מול מרצחי החמאס במלוא צדקתו המוסרית עד להכנעתו ושחרור כל החטופים והבטחת ביטחונה של מדינת ישראל". בשעות שקדמו לבלימת הספינה על ידי צה"ל, טיאגו אבילה, מנהיג המשט שעשה את דרכו לעזה, הודיע כי אמצעי הניווט של הספינה הושבתו. "הם מתכוננים לבלום אותנו או לתקוף", הוא טען. אחרי ההודעה, באפליקציית המעקב אחרי הספינות ניתן לראות את המשט ואת מיקומו.
בסרטון שפרסם אבילה, הוא אמר כי "לפי מערכת הניווט שלנו, אנחנו כבר לא נמצאים במרחק של 162 מיילים ימיים (כ-260 ק"מ) מעזה, שזה איפה שאנחנו נמצאים. אנחנו נמצאים בנמל תעופה בירדן". הוא הציג בסרטון תמונה ולפיה המשט נמצא לכאורה בירדן, אף שלפי הנתונים של אתר המשט הרשמי, הוא נמצא בים.