ב-19 חודשים של מלחמה התמקדו רוב מאמצי צה"ל ברצועת עזה ובלבנון, אך גם ביהודה ושומרון הצליחה ישראל להסב נזק משמעותי לתשתית הטרור. חיסולו בסוף השבוע האחרון של נור ביטאוי, שהוגדר כמבוקש מספר 1 ביהודה ושומרון, היה רק האחרון בשורה ארוכה של סיכולים ממוקדים שביצעה ישראל נגד מטרות בשטחים. מתחילת המלחמה חוסלו ראשי התארגנות הטרור בנור א-שמס, ג'נין, טולכרם ומחנה בלאטה, לצד מחבלים רבים בכירים נוספים.
החיסולים המרכזיים של צה"ל ביהודה ושומרון בוצעו על ידי הימ"ם, יחידת העילית של המשטרה, או על ידי כטב"מים. חיסולו של ביטאוי בוצע בשכם על ידי הימ"ם, והוא היה אחד היעדים הבכירים ביותר של כוחות הביטחון. הוא הוגדר דמות כריזמטית שפעלה מתחת לרדאר במשך שנים, הייתה בין מייסדי גדוד ג'נין, וקידמה שורת תשתיות טרור בגדה. צה"ל רדף אחריו מאז 2023. מדובר במבוקש מרכזי של הג'יהאד האיסלאמי, ששלט על שטח, ידע לארגן ולהכווין חוליות מחבלים ולחבר בין מפגעים.
בדצמבר 2024 חוסל מהאוויר טארק דוש, ראש התארגנות הטרור בטולכרם שפעל במימון איראני והיה בקשר עם פעילי טרור מלבנון לטובת מימוש פיגועים. תשתית הטרור שהוביל הייתה אחראית לשורה של פיגועי ירי לעבר כוחות צה״ל, וכן פיגועי ירי לעבר מחסומים ויישובים סמוכי גדר באזור טולכרם. 4 חודשים קודם לכן חוסל מוחמד ג'אבר ("אבו שג'אע'), ששימש כראש התארגנות הטרור בנור-א-שמס והיה מעורב בפיגועים רבים, כולל הפיגוע שבו נרצח אמנון מוכתר (67) בסוף חודש יוני בקלקיליה.
בכיר נוסף שחוסל בטולכרם, שהפכה למעוז טרור פעיל לאחר 7 באוקטובר, הוא ראש התארגנות חמאס בעיר אשרף נאפע. לפי צה"ל, נאפע תיאם פעולות טרור בגדה, והיה אחראי על ייצור והטמנת מטענים. הוא חוסל מהאוויר ביולי האחרון. בינואר 2024 חוסל גם ראש התארגנות הטרור במחנה בלאטה בשכם, עבדאללה אבו שלאל, שנחשב לאחד מראשי הטרור המרכזיים ביהודה ושומרון.
לצידם חוסלו מחבלים בכירים רבים במעוזי הטרור ביהודה ושומרון. לפי צה"ל, מתחילת המלחמה כוחות הביטחון חיסלו בצפון השומרון למעלה מ-700 מחבלים, ביניהם 36 מחבלים בכירים בהתארגנויות הטרור. מאז תחילת מבצע חומת ברזל בצפון השומרון, שהחל בינואר 2025, חוסלו יותר מ-100 מחבלים, נעצרו כ-320 מבוקשים והוחרמו כ-450 אמצעי לחימה שונים. כמו כן, הושמדו מאות מטעני גחון ומטעני צינור, ועשרות בתים ששימשו כמעבדות מטענים ואמצעי לחימה.
יש לציין שגורמים בכירים במנגנון הטרור ביהודה ושומרון חוסלו הרחק מהאזור עצמו. כך לדוגמה חוסל סאלח אל-עארורי, שהיה אחראי על פעילות חמאס ביהודה ושומרון, בתקיפה ממוקדת של חיל האוויר ברובע הדאחייה בביירות. בדומה לכך, בתקיפה שבוצעה לפני כשנה ברפיח חוסל מחבל יאסין רביע, ראש מטה הגדה של חמאס והמחבל חאלד נגאר, בכיר במטה הגדה.
כמות הפיגועים האדירה - והצניחה בחודשים האחרונים
מאז פרוץ המלחמה חלה עלייה ניכרת במספר הפיגועים ביהודה ושומרון. בחצי השנה האחרונה יצאו לפועל 49 פיגועים משמעותיים וסוכלו 763 פיגועים כאלו, כך לפי נתוני השב"כ. לפי אותם הנתונים, ניתן לזהות ירידה ניכרת במספר הפיגועים המשמעותיים לנוכח המבצע ביהודה ושומרון - ב-3 החודשים האחרונים יצאו לפועל 10 פיגועים, בעוד שב-3 החודשים שלפני כן בוצעו 39 פיגועים.