כמו אתרי מעיינות חמים אחרים, גם חמי עין גדי היה מוקד עלייה לרגל לכל למי שחיפש מקום להירגע בו, לטבול במעיינות חמים ולקבל טיפולים מפנקים. היתרון שהיה לעין גדי, בניגוד למשל לחמי טבריה (שעדיין פעיל) ולחמי יואב (שהפך למלון דרים איילנד) היה כמובן המיקום שלו - ים המלח.
כך, השילוב בין המעיינות החמים לשלל הטיפולים שניתן לקבל באופן טבעי על ידי הבוץ בעל סגולות המרפא, היה שילוב מעולה ללא מעט מבקרים ישראלים ובעיקר לתיירים שהגיעו בהמוניהם מחו"ל.

אך היתרון של המיקום של חמי עין גדי הוא גם מה שהפך בסוף לחיסרון שלו. כך למשל, בהתחלה חמי עין גדי היו קרובים לקו המים שעם השנים הלך ונסוג. הפתרון היה לעשות הסעות בטרקטור מהמבנה המרכזי, אך בסוף היה מדובר בנסיעה איטית של יותר משני קילומטרים בכביש שכל הזמן נהרס.
הבולענים הרבים שנפערו במקום בעקבות התרחקות קו המים פגעו בו מאוד עם הזמן, התחזוקה היתה בלתי אפשרית והסכנה ריחפה באוויר. והוא נסגר לצמיתות ביוני 2021, לאחר דעיכה של שנים שהוחרפה בזמן הקורונה. כיום המבנה של חמי עין גדי עומד נטוש והרוס לגמרי.
